Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMBOX1Q6NT76 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms