Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPPQ6IPU0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms