Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF123Q5XPI4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms