Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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LRRC38Q5VT99 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC38Q5VT99 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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