Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Q5VSD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms