Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMPD1Q5SYB0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms