Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCID2Q5JVF3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms