Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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