Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms