Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP20-2Q3LI61 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms