Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms