Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPHKAPQ2M3C7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPHKAPQ2M3C7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPHKAPQ2M3C7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPHKAPQ2M3C7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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