Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms