Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFKFB3Q16875 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms