Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCOA1Q15788 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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