Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SS18Q15532 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms