Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TLR1Q15399 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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