Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMD6Q15008 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms