Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms