Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNB1Q14721 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNB1Q14721 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms