Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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