Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMC1AQ14683 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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