Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA3AQ14563 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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