Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNC3Q14003 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms