Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPSQ13938 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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