Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ALCAMQ13740 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms