Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BFSP2Q13515 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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