Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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PTPRSQ13332 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PTPRSQ13332 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PTPRSQ13332 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PTPRSQ13332 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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