Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CLN3Q13286 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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