Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CBX3Q13185 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CBX3Q13185 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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