Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CALCOCO2Q13137 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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