Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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