Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RAB40BQ12829 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms