Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NIPAL4Q0D2K0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms