Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms