Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK18Q07002 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms