Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABPAQ06546 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABPAQ06546 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms