Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFHR1Q03591 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFHR1Q03591 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms