Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ERCC6Q03468 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC6Q03468 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms