Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms