Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms