Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MDM2Q00987 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms