Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MYBPC1Q00872 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms