Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FAM3AP98173 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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