Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAE1P78406 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAE1P78406 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms