Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSPHP78330 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSPHP78330 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms