Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2IP63279 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms