Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCBP4P57723 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms