Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUFMP49411 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TUFMP49411 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms