Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NESP48681 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NESP48681 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NESP48681 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NESP48681 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NESP48681 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NESP48681 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NESP48681 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms